Le modèle Factorized Embeddings : vers un atlas cellulaire basé sur les données de séquençage

Assya Trofimov, co-direction avec Claude Perreault

Les technologies de séquençage devenant de plus en plus précises, la définition d’un type cellulaire devient vague et moins pertinente. Dans son travail, Assya Trofimov propose une méthode pour calculer des vecteurs continus pour rendre compte de la variation biologique sans devoir utiliser le codage dur. Puisque les cellules ont simultanément plusieurs facettes discrètes ou continues, tels les types et états cellulaires, la solution optimale pour construire un atlas cellulaire devrait être basée entièrement sur les données. Le projet de thèse d’Assya est donc de créer un atlas cellulaire pour l’humain plus proche du vrai concept d’identité cellulaire.