Mise en place d’une approche pour exploiter les données du projet LINCS afin de caractériser de petites molécules pour le développement de médicament
Les données du projet LINCS L1000 incluent le niveau d’expression d’environ 1000 gènes de 15 lignées cellulaires et d’un peu moins de 300 petites molécules. Au cours de son stage, Laurianne Paquette mettra au point une approche pour caractériser ces petites molécules, ainsi que ces gènes et ces lignées cellulaires, dans le but d’utiliser ces renseignements pour développer des médicaments. Cette approche se base sur les réseaux de neurones et les factorized embeddings.
Mots-clés: bio-informatique, apprentissage machine, réseau de neurones artificiel, transcriptomique, LINCS L1000, factorized embeddings
